地方土種是我國農民數千年辛勤培育并傳承下來的優(yōu)秀農業(yè)遺產，也是中華民族農業(yè)文明的重要成果。我國地域自然條件差異大，歷經長期人工培育與自然選擇遺留下來的眾多優(yōu)質地方土種，是農業(yè)可持續(xù)發(fā)展的寶貴資源，也是我國農業(yè)參與國際分工與競爭的基礎。而隨著商業(yè)育種的開展與規(guī)�；�經營的推進，地方土種逐漸被良種代替，許多優(yōu)質的土種資源逐漸滅絕或瀕臨滅絕，導致農產品由品種、品質多樣性向單一化大規(guī)模種養(yǎng)轉變，長此將引發(fā)我國農業(yè)發(fā)展的多重危機，嚴重影響到中華民族的未來發(fā)展。

1.農業(yè)生物資源消失危機正在加劇。土種資源是重要的生物育種資源，土種含有的地方特色基因異常豐富，是生物研究的重要標本，也是農業(yè)可持續(xù)發(fā)展不可或缺的珍貴資源。而隨著土種的不斷消失，土種擁有的生物物種資源，包含種內的遺傳資源和農業(yè)育種意義上的種質資源也將隨之消失而永遠滅絕。如良種豬進入我國約30年，卻替代了養(yǎng)殖改良近9000年的土豬，很多珍貴的土種豬品種幾乎絕種。據報道，優(yōu)質的溫州平陽土種母水牛僅存欄210頭，種公牛僅剩12頭，絕種岌岌可危。珍貴的農業(yè)遺傳資源是解決人類未來生存和發(fā)展問題的戰(zhàn)略資源，土種的不斷消失將是中華民族的巨大損失。

2.農業(yè)品種多樣性危機不斷顯現。農業(yè)品種多樣性是農業(yè)可持續(xù)發(fā)展的基礎。土種是農業(yè)生態(tài)性的重要標志，也是農業(yè)品種多樣性的根本保證。土種的逐漸消失使農業(yè)品種多樣性被破壞。據統(tǒng)計，50年代初我國種植的小麥品種約10000個，幾乎都是地方品種，迄今推廣的小麥品種全國僅有400多個，其中原有的地方土品種幾乎滅絕。山東省種植的花生品種在1963年大約有470個，1981年尚存30個，到目前不到15個左右。我國的普通野生稻、藥用野生稻和疣粒野生稻已經分別減少大約70%、50%、30%。連享有盛譽的北京烤鴨，市場上90%都不是傳統(tǒng)意義的北京土鴨，而是北京鴨在國外雜交的后代英國“櫻桃谷”鴨。當前我國的規(guī)模農業(yè)正在普遍性丟棄土種和傳統(tǒng)農業(yè)種養(yǎng)方法，實行單一化同質化的農作方式，損害了傳統(tǒng)農業(yè)的品種多樣性，也使農業(yè)抗自然風險能力降低，并容易引發(fā)農產品大面積滯銷的市場風險。

3.食品單一化與安全危機日益嚴重。食品多樣化是人類美好生活的基本要求，也是高質量發(fā)展的重要保障。全面小康社會不僅要滿足人們對食物的數量需求，而且還必須滿足人們對食物品質和品種多樣化的要求。不同品種的特殊性和差異性帶來食品的多樣性。隨著我國土種的不斷消失，單一化的良種豬、肉雞、雜交糧食與洋蔬菜充斥市場，單一趨同化的農產品生產結構必將造成食品單一化危機。同時，當前一些良種在種植過程中使用大量的化肥農藥維持生長，畜禽產品依靠大量激素、添加劑催熟增瘦，過度的生化物品投入造成了潛在的重大食品安全隱患。特別是代替土種的轉基因農產品陸續(xù)進入人們的生活，人們對食品安全的恐慌日益加劇。